Rak prostate: novi indeks za predviđanje agresivnosti tumora

Teško donošenje odluke o neophodnoj terapiji

Samo u Njemačkoj svake godine oko 60 000 muškaraca dijagnosticira rak prostate. Nakon ove dijagnoze, mnogi se ljudi suočavaju s teškom odlukom: je li potrebna operacija ili terapija zračenjem ili je dovoljno za aktivno praćenje lokaliziranih tumora? Za mnoge pacijente ovo je opcija kako bi se izbjegle ponekad značajne nuspojave invazivnog liječenja.

Istraživači su analizirali procese mutacije i razvoj tumora prostate

Otkrivanje najranijih somatskih promjena u raku prostate može pružiti važan uvid u razvoj tumora i pomoći u raslojavanju karcinoma prema visokom i niskom riziku.

Clarissa Gerhäuser i kolege iz DKFZ-a, zajedno sa znanstvenicima sa Sveučilišta u Kopenhagenu i Europskog laboratorija za molekularnu biologiju (EMBL), Sveučilišnog medicinskog centra Hamburg-Eppendorf, Instituta za molekularnu genetiku Max Planck i Sveučilišta Charité iz Berlina analizirali su cjelokupni genom, transkriptom i metilom 292 tumora prostate u ranoj fazi. Uzorci tkiva bili su od pacijenata s dijagnozom starosti ≤55 godina.

Rano, kontinuirano napredujući, enzimom posredovani procesi mutacije

Istraživači su otkrili dobne promjene u genomu i enzimski posredovani proces mutacije koji s vremenom napreduje, što pridonosi najranijim mutacijama raka prostate. Proces mutacije vjerojatno pokreću enzimi APOBEC3. Skupina enzima APOBEC dio je urođenog imunološkog sustava sisavaca. Oštećuju genetski sastav određenih virusa i na taj način smanjuju njihovu održivost.

S druge strane, preaktivni enzimi APOBEC već su identificirani kao uzrok mutacija koje potiču rak. „Pretpostavljamo da APOBEC mijenja stanice prostate polako, ali stalno sa svakom diobom stanica. Tako se možda nakupi 10 do 20 mutacija tijekom možda 20 godina “, kaže koautor Jan Korbel iz EMBL-a.

Četiri molekularne podskupine s različitim razinama rizika

Koristeći epigenetske markere, Clarissa Gerhäuser razvila je "PEPCI", epigenetski indeks karcinoma prostate koji omogućuje lako predviđanje agresivnosti tumora. Koristeći integrativnu analizu epigenetskih markera i obrazaca ekspresije gena, istraživači su identificirali četiri molekularne podskupine tumora koji se razlikuju u tijeku bolesti.

Lokus ESRP1: mogući biljeg prognoze

U posebno agresivnoj, vrlo brzo podijeljenoj podskupini tumora dolazi do dupliciranja i povećane ekspresije gena ESRP1 (regulatorni protein za spajanje epitela). Istraživači su potvrdili ovu povezanost pomoću 12 000 uzoraka tkiva. Mutacija ESRP1 stoga je perspektivan kandidat za prognostički marker koji se može otkriti u ranim fazama raka.

Podaci o sekvenciranju DNA omogućuju predviđanja kliničkog ishoda

Istraživači su kombinirali informacije o molekularnim karakteristikama i riziku od razvoja bolesti specifičnom za grupu u računalnom modelu. PRESCIENT se trenutno primjenjuje u kliničkoj njezi u Charitéu u Berlinu. Znanstvenici u model žele dodati podatke nekoliko tisuća pacijenata. Za otprilike dvije do tri godine model bi se mogao primijeniti kao sastavni dio kliničkih procesa i pomoći predvidjeti kako će se rak prostate razviti u određenog pacijenta.